中国科学院亚热带农业生态研究所（以下简称“亚热带生态所”）创建于1978年，其前身为中国科学院长沙农业现代化研究所，2003年10月改为现名。

　　亚热带生态所主要学科方向为亚热带复合农业生态系统生态学，下设喀斯特区域农业生态研究中心、农田生态研究中心、湿地农业生态研究中心、流域农业环境研究中心、畜禽健康养殖与农牧复合生态研究中心、作物分子生态研究中心等六个研究中心，作为依托单位拥有畜禽养殖污染控制与资源化技术国家工程实验室、中国科学院亚热带农业生态过程重点实验室、农业生态工程湖南省重点实验室、动物营养生理与代谢过程湖南省重点实验室、湖南省畜禽健康养殖工程技术研究中心和广西石漠化治理工程技术研究中心，建有桃源农业生态系统观测研究站、环江喀斯特生态系统观测研究站、洞庭湖湿地生态系统观测研究站和长沙农业环境观测研究站。　　

　　截至2023年底，亚热带生态所共有在册职工203人。其中，中国工程院院士1人，国家“杰青”1人，国家“优青”2人（含海外项目1人），国家百千万人才高层次人选2人，国家高层次人才特殊支持计划入选者6人，全国优秀科技工作者1人，国家“创新人才推进计划”中青年科技创新领军人才1人、重点领域创新团队2个，享受国务院政府特殊津贴专家11人，中国科学院人才引进计划入选者9人、创新（青年）交叉团队2个、青年促进会会员20人、青年促进会优秀会员6人、特聘研究岗位人员28人、“西部之光”入选者25人、“王宽诚率先人才计划”产研人才扶持项目1人，湖南省人才引进计划入选者2人、“杰青”13人、“优青”2人、科技领军人才5人、121创新人才培养工程入选者5人、光召科技奖1人，“十大同心人物”2人、享受湖南省政府特殊津贴专家2人、湖湘青年英才6人、“三尖”创新人才14人，广西省八桂学者2人，八桂青年学者2人。

　　现拥有生态学博士学位授予点，生态学、畜牧学以及环境工程学硕士学位授予点；有生态学专业学科博士后流动站。目前在读研究生203人，国际学生4人，硕士生102人，博士生101人，在站博士后50余人。

　　亚热带生态所是湖南省生态学会、湖南省土壤学会、湖南省动物营养与生态环境学会挂靠单位，主办有《农业现代化研究》期刊。