中国科学院特聘研究员Andrew Whiteley教授学术报告会

2014-10-16      】

  应土壤环境与生态研究组吴金水研究员邀请,国际著名土壤微生物学家,我所外籍特聘研究员,西澳大学、中澳土壤生物系统联合实验室教授Andrew Whiteley及Deepak Kumaresan博士于2014年10月20–30日访问我所,开展“下一代环境组学数据的生物信息学研讨会(Bioinformatics for Next Generation Environmental data)”及土壤微生物前沿研究的学术讲座与交流,并讨论双边合作事宜。

  其学术报告安排如下,欢迎各位老师和同学参加。

  10月21日 (星期二)

  9:00-10:30 MicroBlitz: One year on and what have we learned about Citizen Science and our environment? (Prof. Andrew Whiteley)

  10:30-10:45 Tea and coffee break

  10:45-12:00 Microbial life in Movile Cave (Romania) – an unusual cave ecosystem

  (Dr. Deepak Kumaresan)

  报告地点:所一楼会议室

  联系人:王娟、葛体达

  10月22日 (星期三)

  Workshop on Bioinformatics for Next Generation Environmental data

  9:00-11:30  Qiime-based analysis of 16S rRNA gene amplicon sequences

  14:30-16:30  Next-generation sequence analysis of functional gene sequences

  16:30-17:30  Hands-on experience and discussion

  10月23日 (星期四)

  Workshop on Bioinformatics for Next Generation Environmental data

  9:00-11:30: Shot-gun metagenome sequence analysis using MG-RAST platform

  14:30-16:30  Shot-gun metagenome sequence analysis using IMG platform and other tools

  16:30-17:30  Hands-on experience

  * User-group formation and discussion (4-5 groups depending on the number of participants)

  10月24日 (星期五)

  Workshop on Bioinformatics for Next Generation Environmental data

  9:30-11:30 User-group discussions

  14:30-17:30 User-group presentations

  *We can choose to use our own sequences or can use publicly available sequences from MG-RAST or IMG.

  地点:所206会议室

  联系人:王娟、葛体达

  Andrew Whiteley在我们所的详细日常安排见附件。

  欢迎各位老师、同学参加讨论!

  报告人简介:

  Prof. Dr. Andrew Whiteley教授,西澳大学State’s newest Premier’s Fellow,他的研究主要围绕陆地、海洋和极地环境微生物多样性进行,应用DNA编码技术解析土壤微生物种群、建立“健康”和“退化”环境的分子微生物指纹图谱。在进入西澳大学之前,他在牛津大学建立了国际著名分子生态学实验室,率先开发了RNA稳定同位素探针、“格里菲斯”DNA和RNA共提取方法等技术,奠定了商品化试剂盒和基于Raman的微生物细胞的显微镜技术的基础。最近他负责了世界上第一个5km分辨率的国家尺度上的微生物多样性图谱,以及相关的土壤健康、环境因素和地理特征。同时,他还致力于研究环境DNA研究的民众参与机制。比如他领导的民众科学项目中的“微晶石”计划(MicroBlitz),通过收集和递交澳大利亚公民DNA序列的样本用来微生物多样性图谱的绘制。在Nature等期刊发表了有关分子微生物生态学论文80多篇。文章引用超过5000多次,H指数为40,i指数(论文引用次数超过10次的)为72。

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