随着规模化、集约化畜禽养殖业的快速发展，现阶段我国畜牧业存在人畜争粮、养殖废弃物排放量大、种养脱节、资源化利用水平低、面源污染严重等问题，给农业农村现代化、生态文明建设带来了严峻挑战。
目前，我国畜禽粪便利用率仅为60%左右，来自畜禽养殖废弃物的COD、总氮、总磷分别占农业面源污染的98%、38%、56%，畜禽养殖废弃物中残留的抗生素和重金属已严重威胁到土壤环境安全、食品安全和人民健康。
习近平总书记指出，加快推进畜禽养殖废弃物处理和资源化利用，关系6亿多农村居民生产生活环境，关系农村能源革命，关系不断改善土壤地力、治理好农业面源污染，是一件利国利民利长远的大好事。2017年6月，在长沙举行的全国畜禽养殖废弃物资源化利用会议强调，要全面推进畜禽养殖废弃物资源化利用、构建种养结合、农牧循环的可持续发展新格局。
湖南是畜禽养殖大省，近年来各地政府从环保角度出台“禁养”“限养”措施，虽然为环境保护减轻了负载，但也影响到畜禽养殖业和种植业的健康可持续发展。推动畜禽养殖源头和养殖过程废弃物减控及其生态增效综合利用，实现种养结合、变废为宝已成为当务之急。
为加速这一进程，建议湖南联合国内外相关科研院所、大学和大型生产企业合作共建国家级工程实验室，努力在畜禽养殖污染控制领域的关键技术和产业化方面取得重大突破，实现养殖废弃物资源化利用技术和产品的标准化，推动技术和产品的市场化、产业化和国际化。该国家级工程实验室的主要目标与建设路径为——
推动畜禽养殖污染治理从末端治理向综合治理转变、从单纯的废弃物治理向与生态文明建设相结合转变。我国现有养殖污染防治模式包括种养区域平衡一体化模式、规模化养殖场达标排放模式、以沼气工程技术为纽带的能源化模式、以生物有机肥生产为核心的资源化利用模式、以发酵床养猪技术为核心的零排放模式等等。其中肥料化还田是国际上畜禽粪便处理和利用的主要方向，也是我国今后大规模处理畜禽养殖粪污的首选技术。实验室要研究确定一定区域范围内种植业与养殖业的比例，助推构建科学合理的农业生产结构、实现生态农业的良性循环，为研究制订相关政策法规提供技术支持。
以技术原始创新为主线，研发出能够满足规模化养殖场和分散型养殖户畜禽废弃物“高处理效率、高处理质量、高循环利用、低运行成本”的国内领先、国际先进的系列技术与装备。制定完善养殖污水处理、畜禽粪便和沼液生产新型有机肥和饲料原料的质量标准、技术标准和评价体系；研发畜禽养殖污染控制与资源化的关键技术、系列产品和成套装备，并在养殖大省和生态敏感区开展示范推广，促进畜禽健康养殖、生态循环农业等行业技术不断更新升级；开展生态循环农业发展模式等前瞻性、战略性研究，使畜禽养殖污染物得到完全资源化开发。
突破我国畜禽养殖污染控制与资源化面临的多个技术瓶颈。重点在畜禽养殖污染物源头减量、废弃物固液高效分离、畜禽粪便好氧发酵及资源化、养殖污水稳定快速发酵、养殖污水和沼液高效脱氮脱磷、沼液沼渣重金属抗生素高效去除等方面取得技术突破。创制新型有机肥和环保饲料，开发畜禽养殖废弃物处理工艺，通过与畜牧兽医、农业环境等技术推广部门及骨干企业合作，建立多个示范基地，建成“研发-示范验证-应用推广”三位一体的技术转化网络体系。
聚集和培育畜禽养殖污染控制与资源化高效利用领域优秀创新人才。坚持“产-学-研-用”相结合，在产业应用基础研究和新技术研发过程中，通过不同形式大量聚集、大力培养各类优秀研发人员、企业技术人员、创新工程推广人员，组织他们参与项目开发和转化应用，聚力实现技术的自主创新、快速转化和推广应用。
围绕养殖废弃物减量化、无害化、资源化的迫切需求，在湖南建设畜禽养殖污染控制与资源化技术国家工程实验室，开展关键技术研发与集成示范，可大力推进我国畜牧业以及与其相关联的生态环保产业、优势特色农业的健康可持续发展，保障我国食品安全、生态安全、人民健康和社会稳定，同时为实施“创新引领、开放崛起”战略、建设富饶美丽幸福新湖南打下坚实基础。